Actividad 2.2

Uso y adaptación de cálculos bioinformáticos a recursos de computación de alto rendimiento

 

Los problemas que se resuelven en el proceso para el estudio de diversidad filogenética requieren la realización de un enorme número de operaciones de cálculo, lo que hace que su resolución en ordenadores convencionales no sea práctica. Existen sistemas de computación específicos para problemas que requieren velocidades de cálculo elevadas, llamados "supercomputadores".
En el proyecto se gestionará el acceso a recursos de supercomputación puestos a disposición de la comunidad científica, la adaptación de los algoritmos de cálculo al sistema a desarrollar y un sistema que permita independizar la herramienta del recurso utilizado. Se prevé utilizar la infraestructura y servicios de apoyo de la Red Española de Supercomputación (RES), de la que es miembro el Gobierno de Canarias a través del ITC. Además se hará uso de los servicios web que pone a disposición el Instituto Europeo de Bioinformática (perteneciente al Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL-EBI).

 

Área geográfica de desarrollo de la actividad: Canarias